8. listopada 1954. godine dio učenika iz II. osnovne škole zajedno s novopridošlim učenicima, pretežito iz južnog dijela tadašnje općine Šibenik, prešao je u novu adaptiranu zgradu Sjemeništa. Tako je zaživjela III. osmogodišnja škola. Njenim upraviteljem je imenovan tadašnji nastavnik Alfonso Foscio.
9. rujna 1973. sadašnja zgrada nove škole je predana na uporabu. Zgradu je preuzela III. osnovna škola Šibenik. Nova škola je dobila ime Osnovna škola Maršala Tita. Ravnatelj je bio Nikola Radovčić, pedagog Alfonso Foscio, tajnica Vlasta Krnić.
1989. godine za ravnatelja je izabran Petar Kerić, nastavnik matematike, a tajnica Vlasta Krnić. Krajem kolovoza 1991. godine za ravnateljicu je izabrana Elida Živković-Pamić, profesorica hrvatskog jezika.
23.4.2001.- 23. 3. 2010. dužnost ravnatelja OŠ Jurja Šižgorića obnaša Nediljko Bojčić, učitelj hrvatskog jezika.
Od 23. 3. 2010. ravnatelj škole je Emil Smerdel, učitelj tehničke kulture, fizike i informatike.
Od 3. 12. 2015. godine ravnateljica Škole je Ivana Rupić, profesorica likovne kulture i likovne umjetnosti.
Za blagdan sv. Jurja, 23. travnja 1992. na svečanosti koja je upriličena u samoj školi službeno je škola zaživjela novim imenom: Osnovna škola Jurja Šižgorića. Jurjevdan je od tada i službeno Dan škole.
Projektant škole je ing. arh. Igor Kolombo, a na školi su još radili i statičar, ing. građ. Žarko Vudrag te kao suradnik ing. arh. Ivo Stipaničev.
U školi se mogu vidjeti zidne slike koje je izradio Raoul Raul Goldoni (Split, 27. siječnja 1919.- Zagreb, 24. ožujka 1983.), hrvatski slikar, kipar, likovni urednik, projektant interijera, dizajner.
31. srpnja 2018. godine gradonačelnik Željko Burić potpisao je s predstavnicima izvođača radova, tvrtki Reliance d.o.o. Split i Polinom, ugovor o energetskoj obnovi Osnovne škole „Juraj Šižgorić“. Radovi na energetskoj obnovi škole završeni su u 2020. godini. 🙂
